Colossal Biosciences présente une plateforme IA dédiée aux efforts de dé-extinction
Colossal Biosciences a annoncé une nouvelle plateforme d’intelligence artificielle appelée GenoMorph, visant à accélérer ses initiatives pour ressusciter des espèces disparues. Cette annonce intervient alors que l’entreprise s’efforce de ramener le dodo, un projet entravé par des données génétiques limitées.
La plateforme GenoMorph intègre des techniques avancées, y compris la morphologie 3D, la génomique comparative et la biologie du développement. Cet approche vise à identifier les gènes nécessaires aux projets de dé-extinction, malgré des lacunes considérables dans les données génétiques disponibles. Actuellement, Colossal ne travaille qu’avec un seul génome de dodo, un contraste frappant avec les centaines de génomes accessibles pour son projet de mammouth laineux. Cette disparité provient des différences dans les taux de conservation de l’ADN entre les environnements froids du mammouth et le climat tropical où vivait le dodo.
« Normalement, les scientifiques peuvent comparer de nombreux génomes pour comprendre quelles différences génétiques sont responsables de certains traits », a déclaré Ben Lamm, PDG et co-fondateur de Colossal. « Nous n’avons pas ce luxe avec l’ADN ancien des espèces disparues dont l’ADN est sévèrement limité, et nous ne pouvons obtenir qu’un petit nombre de génomes complets. »
Pour développer GenoMorph, Colossal a compilé d’importantes données de développement provenant d’espèces telles que les poules, les cailles, les canards et les pigeons, ainsi que des informations génétiques et des mesures de crâne 3D de plus de 70 espèces d’oiseaux. Ce travail a duré plus d’un an et s’inscrit dans le cadre des recherches continues de l’entreprise sur la dé-extinction.
« L’IA apprend quelles régions de l’ADN sont actives à mesure que différents oiseaux développent leurs becs et leurs structures faciales, et utilise ces informations pour prédire quels commutateurs génétiques ont pu donner au dodo son apparence iconique », a expliqué Lamm. Il a comparé GenoMorph à une « carte au trésor du génome du dodo », facilitant les recherches ciblées sur des changements génétiques significatifs.
Jusqu’à présent, la plateforme a identifié environ 2 300 cibles potentielles pour l’édition de l’ADN en rapport avec la morphologie cranio-faciale du dodo, qui seront soumises à des tests en laboratoire. Lamm a souligné que GenoMorph aborde un défi majeur de la dé-extinction : déterminer quelles caractéristiques rendent une espèce disparue unique. Toutefois, la faisabilité de ces modifications pour produire les traits physiques souhaités reste à confirmer.
Colossal a également développé un nouveau système utilisant des nanoparticules lipidiques pour délivrer des outils d’édition génétique directement dans les embryons d’oiseaux en développement. Cette avancée permet aux chercheurs d’observer l’impact des changements génétiques sans attendre les cycles de reproduction complets.
De plus, l’entreprise a révélé que sa colonie de pigeons nicobariens avait augmenté à 36 oiseaux et qu’elle avait réussi à générer les cellules précurseurs qui se développent en œufs et en spermatozoïdes. Étant donné que le pigeon nicobarien est le plus proche parent vivant du dodo, ces cellules jouent un rôle crucial dans la stratégie de Colossal pour développer des oiseaux avec des traits de dodo. Lamm s’est montré optimiste quant à la convergence des différentes technologies au sein de leurs projets.
Face aux préoccupations concernant la sécurité de l’édition génétique, Lamm a souligné que GenoMorph vise à améliorer la précision, le contrôle et testabilité de l’ingénierie génétique. Il a précisé que la plateforme facilite l’identification de modifications potentielles sans les exécuter immédiatement. « Identifier une modification potentielle ne signifie pas que nous l’introduisons immédiatement dans un animal ou que nous supposons qu’elle est sans danger », a-t-il affirmé, soulignant qu’une validation approfondie est essentielle pour une prise de décision éclairée.
Colossal Biosciences a également été reconnue par Peter Diamandis, fondateur d’XPRIZE, qui a annoncé la création de NeoGenesis Capital, un nouveau fonds de capital-risque destiné à soutenir les entreprises utilisant la plateforme de biologie programmable de Colossal dans les domaines de la santé, de l’agriculture et de la conservation.
